A Exposição Permanente do Museu está organizada de forma cronológica. Abarca um espaço temporal que vai desde os primórdios do contacto do homem com a figura mitológica do toiro bravo (5000 AC), passando pela história da Tauromaquia Portuguesa (do século XIII até à actualidade). Foca-se, sobretudo, na história taurina da cidade de Lisboa e, em particular, na história da Praça de Touros do Campo Pequeno.
As duas salas principais do museu são dedicadas à história da Tauromaquia, existindo, ainda, duas salas temáticas: a sala dedicada ao Toiro de Lide, fazendo uma viagem pela criação e vida deste extraordinário animal; e a sala alusiva ao Forcado, onde se pode conhecer mais em pormenor a história e evolução desta figura única da Tauromaquia Portuguesa e Mundial.
O museu possui, ainda, um espaço multimédia, onde o visitante, de forma interactiva, pode explorar uma linha cronológica da História da Tauromaquia; conhecer os vários momentos de uma corrida de toiros; encontrar alguns aficionados famosos; revisitar os trajes dos vários intervenientes na corrida; além da visualização de fotos e vídeos sobre as corridas de toiros.